Anwendung und Nutzen molekularer Marker innerhalb der Gattung Populusfür den Einsatz in der Züchtung

Anhand von über 500 Individuen sind für 14 Populus-Arten SNP- und InDel (Insertionen/Deletionen) -Marker sowohl im Chloroplastengenom (cp) als auch im Kerngenom entwickelt worden. Unter Einsatz von 24 Abschnitten im cp-Genom wurden insgesamt über 200 variable Nukleotidstellen gefunden. Von diesen waren pro Art einer bis zu 30 SNPs/InDels artspezifisch, also jeweils nur in einer Art zu finden. Mit Hilfe dieser cp-Marker wird der mütterliche Teil einer Kreuzung und damit die Kreuzungsrichtung verifiziert. In fünf Bereichen des Kerngenoms wurden etwa 190 Nukleotid- Variationen gefunden, die pro Art in einem bis zu 17 artspezifischen SNPs/InDels resultierten. Im cp-Genom konnten so insgesamt für die untersuchten Arten über 100 und im Kerngenom 70 artspezifische Variationen entdeckt werden. Die Kombination dieser Marker ermöglicht die eindeutige Identifizierung von 13 der 14 untersuchten Arten. Ebenso können anhand mehrerer Kernmarker Genealogien zurückverfolgt und Komplexhybride identifiziert werden.