Preliminary insight into fungal diversity on imported cut greenery with reference to some potential implications for plant health
Large quantities of cut greenery are imported into the European Union to meet the constantly increasing demand in the floristic market. So far, comprehensive information on organisms associated with this cut greenery is lacking and, thus, no basic data is available for evaluating the associated phytosanitary risk. The present study examined cut greenery imported from third countries to Germany with the aim to provide an initial evaluation on the diversity and ecological function of the associated fungi. Totally, 1571 fungal isolates were recovered from 51 samples of cut greenery belonging to 27 plant species originated from eight countries. After grouping into morphotypes, representative isolates were identified based on the ITS region of the rDNA and assigned to functional groups. Taxonomic identification delimited 3 phyla, 8 classes, 39 families, 68 genera and 112 species. At different taxonomical levels (from phyla to genus), Ascomycota, Dothideomycetes, Sordariomycetes, Colletotrichum, Xylaria, Penicillium and Neopestalotiopsis were the most frequent taxa. Fungal community composition varied with plant species, and the highest diversity was recovered from Gaultheria shallon and palm cut greenery. Fungi were assigned into 7 trophic modes and 16 functional groups of which the category of putative plant pathogens was highest with 72% relative abundance. Strong overlap in fungal communities of asymptomatic and diseased samples mostly consisting of plant pathogens indicated that various pathogens live endophytically or asymptomatically in cut greenery. Especially, the outcome of this work can be the baseline for further in-depth studies to assess the phytosanitary implications of cut greenery import.
Große Mengen von Schnittgrün werden importiert um den wachsenden Bedarf der Europäischen Union auf dem Blumenmarkt zu decken. Bislang fehlen Informationen zu den mit diesem Schnittgrün assoziierten Organismen, somit liegen keine Grundlagendaten vor um das damit einhergehende phytosanitäre Risiko einzuschätzen. Die vorliegende Studie untersuchte importiertes Schnittgrün aus Drittstaaten nach Deutschland und zielt darauf ab, eine erste Evaluierung der Diversität und ökologischen Funktion von assoziierten Pilzen zu erlangen. Insgesamt wurden 1571 Pilzisolate aus 51 Proben aus 8 Ländern stammenden 27 Schnittgrünarten gewonnen. Nach Gruppierung in Morphotypen, wurden repräsentative Isolate mittels ITS Region der rDNA identifiziert und anschlie- ßend zu funktionalen Gruppen zugeordnet. Es wurden 3 Phyla, 8 Klassen, 39 Familien, 68 Gattungen und 112 Arten identifiziert. Auf unterschiedlichen taxonomischen Ebene (von Phylum bis Gattung), waren Ascomycota, Dothideomycetes, Sordariomycetes, Colletotrichum, Xylaria, Penicillium und Neopestalotiopsis die häufigsten Taxa. Die Zusammensetzung der Pilzgemeinschaft variiert nach Pflanzenart des Schnittgrüns, mit der höchsten Diversität aus Gaultheria shallon und Palme. Die Pilze wurden 7 trophischen und 16 funktionalen Gruppen zugeordnet, von denen die Kategorie der Pflanzenpathogene mit insgesamt 72 % die höchste relative Häufigkeit aufwies. Die stark überlappenden Pilzgemeinschaften von asymptomatischem und erkranktem Schnittgrün zeigten, dass eine Vielzahl von Pathogenen das Schnittgrün auch endophytisch oder asymptomatisch besiedeln. Insbesondere können die Ergebnisse dieser Studie als Ausgangspunkt für künftige tiefergreifende Untersuchungen zu pflanzengesundheitlichen Auswirkungen von Schnittgrünimporten dienen.
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