• Forschungsdaten
  • The OHEJP BeONE Project – Salmonella enterica genome assembly dataset

The OHEJP BeONE Project – Salmonella enterica genome assembly dataset

Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Mixão, Verónica;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Pinto, Miguel;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Gomes, João Paulo;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Sobral, Daniel;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Brendebach, Holger;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Deneke, Carlus;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Tausch, Simon;
Zugehörigkeit
Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise (IZSAM), Italy
Di Pasquale, Adriano;
Zugehörigkeit
National Institute of Public Health and the Environment (RIVM), Netherlands
Swart-Coipan, Claudia;
Zugehörigkeit
National Veterinary Research Institute of Poland (PIWET), Poland
Iwan, Ewelina;
GND
1022638580
Linde, Jörg;
Zugehörigkeit
Norwegian Veterinary Institute (NVI), Norway
Lagesen, Karin;
Zugehörigkeit
Animal and Plant Health Agency (APHA), United Kingdom
Petrovska, Liljana;
Zugehörigkeit
Norwegian Institute of Public Health (NIPH), Norway
Umaer Naseer, Mohammed;
Zugehörigkeit
Technical University of Denmark (DTU), Denmark
Sommer Kaas, Rolf;
Zugehörigkeit
Robert Koch Institute (RKI), Germany
Simon, Sandra;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Joensen, Katrine;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Kiil, Kristoffer;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Nielsen, Sofie;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Borges, Vítor

s dataset comprises the genome assemblies of 1,540 Salmonella enterica samples collected by the BeONE Consortium on behalf of the One Health European Joint Programme “BeONE: Building Integrative Tools for One Health Surveillance” (https://onehealthejp.eu/jrp-beone/). Additionally, a complementary dataset is also made available (https://zenodo.org/record/7119735), comprising genome assemblies of 1,434 S. enterica samples selected among the Whole-Genome Sequencing (WGS) data publicly available in the European Nucleotide Archive (ENA) or in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) Sequence Read Archive (SRA).

Einordnung

Erschienen in:
Zenodo
Auflage:
Version v1
Datum der Veröffentlichung:
31.10.2022
DOI:
10.5281/zenodo.7267786
Sprache:
Englisch
Ressourcentyp:
Text
Umfang:
2 Dateien
Verlag:
Zenodo
Schlagwörter:
Salmonella enterica; Genomic data; One Health; OHEJP BeONE Project
DDC-Sachgruppe der DNB:
570 Biowissenschaften, Biologie
Link URL:
https://zenodo.org/record/7267786
Link zum Kontext:
https://zenodo.org/communities/ohejp/
Einrichtung:
Friedrich-Loeffler-Institut, Institut für Bakterielle Infektionen und Zoonosen

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