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  • The OHEJP BeONE Project – Escherichia coli genome assembly dataset

The OHEJP BeONE Project – Escherichia coli genome assembly dataset

Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Mixão, Verónica;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Pinto, Miguel;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Gomes, João Paulo;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Sobral, Daniel;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Brendebach, Holger;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Deneke, Carlus;
Zugehörigkeit
German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), Germany
Tausch, Simon;
Zugehörigkeit
Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise (IZSAM), Italy
Di Pasquale, Adriano;
Zugehörigkeit
National Institute of Public Health and the Environment (RIVM), Netherlands
Swart-Coipan, Claudia;
Zugehörigkeit
National Veterinary Research Institute of Poland (PIWET), Poland
Iwan, Ewelina;
GND
1022638580
Linde, Jörg;
Zugehörigkeit
Norwegian Veterinary Institute (NVI), Norway
Lagesen, Karin;
Zugehörigkeit
Animal and Plant Health Agency (APHA), United Kingdom
Petrovska, Liljana;
Zugehörigkeit
Norwegian Institute of Public Health (NIPH), Norway
Umaer Naseer, Mohammed;
Zugehörigkeit
Technical University of Denmark (DTU), Denmark
Sommer Kaas, Rolf;
Zugehörigkeit
Robert Koch Institute (RKI), Germany
Simon, Sandra;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Joensen, Katrine;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Kiil, Kristoffer;
Zugehörigkeit
Statens Serum Institut (SSI), Denmark
Nielsen, Sofie;
Zugehörigkeit
National Institute of Health Doutor Ricardo Jorge (INSA), Portugal
Borges, Vítor

This dataset comprises the genome assemblies of 308 Escherichia coli samples collected by the BeONE Consortium on behalf of the One Health European Joint Programme “BeONE: Building Integrative Tools for One Health Surveillance” (https://onehealthejp.eu/jrp-beone/). Additionally, a complementary dataset is also made available (https://zenodo.org/record/7120057), comprising genome assemblies of 1,999 E. coli samples selected among the Whole-Genome Sequencing (WGS) data publicly available in the European Nucleotide Archive (ENA) or in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) Sequence Read Archive (SRA).

Einordnung

Erschienen in:
Zenodo
Auflage:
Version v1
Datum der Veröffentlichung:
31.10.2022
DOI:
10.5281/zenodo.7267845
DOI:
10.5281/zenodo.7267844
Sprache:
Englisch
Ressourcentyp:
Text
Umfang:
2 Dateien
Verlag:
Zenodo
Schlagwörter:
Escherichia coli; Genomic data; One Health; OHEJP BeONE Project
DDC-Sachgruppe der DNB:
570 Biowissenschaften, Biologie
Link URL:
https://zenodo.org/record/7267845
Link zum Kontext:
https://zenodo.org/communities/ohejp/
Link zum Kontext:
https://onehealthejp.eu/jrp-beone
Einrichtung:
Friedrich-Loeffler-Institut, Institut für Bakterielle Infektionen und Zoonosen

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