NcbiExplorer: Java desktop application to query the NCBI nucleotide database and automatically download sequences into a multi-FASTA file

Hofmann, Andreas

doi:10.5281/zenodo.6413522

Forschungsdaten Di., 05. Apr.. 2022 Open-Access

Veröffentlicht

NcbiExplorer : Java desktop application to query the NCBI nucleotide database and automatically download sequences into a multi-FASTA file

Eine ausführbare Java Desktop-Endnutzer-Anwendung, mit deren Hilfe die NCBI Nukleotid-Datenbank („GenBank“: https://ncbi.nlm.nih.gov/GenBank) nach bestimmten, Nutzer-definierten Kriterien abgefragt werden und die entsprechenden DANN-Sequenzen in einem weiterverarbeitbaren Format heruntergeladen werden.

Vorschau

Einordnung

Erschienen in:: Zenodo
Auflage:: Version 0.4
Datum der Veröffentlichung:: 05.04.2022
DOI:: 10.5281/zenodo.6413522
Sprache:: Englisch
Ressourcentyp:: Text
DDC-Sachgruppe der DNB:: 004 Informatik
DDC-Sachgruppe der DNB:: 570 Biowissenschaften, Biologie
Link URL:: https://zenodo.org/record/6413522#.YoStEIxCSUk
Link zum Volltext:: https://zenodo.org/record/6413522/files/NcbiExplorer_v0.4_java1.8.jar?download=1
Einrichtung:: Max Rubner-Institut, Nationales Referenzzentrum für authentische Lebensmittel
Physischer Standort:: S2220