Flow cytometric investigations on Pelargonium × crispum: an estimation of nuclear DNA contents with two different internal standards

Plaschil, Sylvia GND; Abel, Simone GND; Klocke, Evelyn GND

Sieben Pelargonium × crispum Sorten, vier Zuchtklone und die Art P. crispum wurden mit der Durchflusszytometrie untersucht. Für die Bestimmung der DNA-Gehalte wurden die zwei internen Standards Tomate ‘Stupické’ (2C-Wert = 1.96 pg) und Blumenkohl ‘Korso’ (2C-Wert = 1.31 pg) verwendet. Wie erwartet, unterschieden sich die 2C-Werte der untersuchten diploiden Genotypen signifikant von denen der tetraploiden. Insgesamt variierten die 2C-Werte zwischen 0.97 und 2.18 pg DNA und bildeten drei signifikant unterschiedliche Gruppen. Die ermittelten DNA-Gehalte waren unabhängig vom verwendeten Standard mit einer Ausnahme: der DNA-Gehalt der Art P. crispum gemessen mit ‘Korso‘ unterschied sich signifikant vom DNA-Gehalt, der mit ‘Stupické’ bestimmt wurde. Die Standards ‘Stupické’ und ‘Korso’ sind für durchflusszytometrische Untersuchungen von Genotypen mit 2C-Werten < 1.8 pg wie Diploide der Sektion Pelar­gonium gleichermaßen geeignet. Jedoch ist die Tomate ‘Stupické’ ein ungeeigneter Standard für Geno­typen mit 2C-Werten von ca. 2 pg, weil sich die Positionen der 2C-Werte der Probe und des Standards überlappen.

Seven Pelargonium × crispum cultivars, four breeding clones and the species P. crispum were analysed by flow cytometry. Tomato ‘Stupické’ (2C value = 1.96 pg) and cauliflower ‘Korso’ (2C value = 1.31 pg) were used as inter­nal standards to estimate the DNA content of the samples. As expected, the 2C values of the investigated diploid and tetraploid genotypes discriminated significantly. Overall, the mean 2C values ranged from 0.97 to 2.18 pg DNA and formed three significantly different groups. The estimation of the DNA content of the cultivars and breeding clones was independent of the standard used with one exception; for P. crispum the estim­ated DNA contents differed significantly. The standards ‘Stupické’ and ‘Korso’ are equally appropriate for flow cyto­metric investigation of genotypes with 2C values < 1.8 pg like diploid genotypes of the section Pelargonium. Tomato ‘Stupické’ is a rather impractical standard for geno­types with 2C values of about 2 pg, due to the overlapping positions of the 2C values of sample and standard.

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Plaschil, Sylvia / Abel, Simone / Klocke, Evelyn: Flow cytometric investigations on Pelargonium × crispum: an estimation of nuclear DNA contents with two different internal standards. 2020.

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