Bodenmikroorganismen - Unbekannte Ressourcen, Leistungen und Potentiale
Mikroorganismen, d. h. Bakterien, Archaeen, Pilze und Protozoen garantieren mit ihrer Stoffwechselaktivität direkt und indirekt wichtige Ökosystemleistungen von Böden. Ihre Diversität, Leistuingen und Potentiale lassen sich nicht durch klassische mikrobiologische Techniken erfassen. Die meisten Mikroorganismen aus Böden sind bis heute nicht im Labor kultivierbar und damit auch nicht taxonomisch und physiologisch charakterisiert. Neue Methoden der Analysen von direkt aus Boden extrahierter DNA und RNA bieten die Möglichkeit, unter Nutzung von stabilen Isotopen und den Werkzeugen der Bioinformatik die Diversität und Aktivität mikrobieller Lebensgemeinschaften mit Hilfe dr Metagenomik und Transkriptomik aufzuklären. Die meisten Bodenmikroorganismen leben in engem Kontakt mit Bodenpartikeln in Bodenaggregaten. Durhc die heterogene Struktur von Böden kommt es so zur Koexistenz unterschiedlichster mikrobieller Lebensgemeinschaften und Stofftransformationen auf engstem Raum...
Microorganisms, including bacteria, archaea, fungi and protozoa, provide with their metabolic activities directly or indirectly important soil ecosystem services. Their diversity, services and potentials cannot be detected with classical microbiological techniques. Most microorganisms from soil are yet not cultivable in the laboratory and thereby cannot ultimately be identified for their taxonomy or physiology. New methods for analysing directly extracted DNA or RNA from soils, utilizing stable isotopes and bioinformatics as tools, provide new perspectives for characterizing the diversity and activity of soil microbial communities utilizing metagenomics and transcriptomics. Most microorganisms live in soil closely attached to soil particles clustered together in aggregates. The heterogeneous soil structure allows for co-existence of different microbial communities and substrate transformation within close vicinity...
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